MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III plasmid pST-III

Total Repeats: 786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014558	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183775
2	NC_014558	TGA	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183775
3	NC_014558	AAC	2	6	443	448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183775
4	NC_014558	ATAC	2	8	489	496	50 %	25 %	0 %	25 %	308183775
5	NC_014558	GTTG	2	8	497	504	0 %	50 %	50 %	0 %	308183775
6	NC_014558	CAG	2	6	558	563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183775
7	NC_014558	A	7	7	585	591	100 %	0 %	0 %	0 %	308183775
8	NC_014558	AT	3	6	671	676	50 %	50 %	0 %	0 %	308183775
9	NC_014558	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183775
10	NC_014558	GAA	2	6	729	734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183775
11	NC_014558	GAA	3	9	767	775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183775
12	NC_014558	ATG	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183775
13	NC_014558	CCA	2	6	801	806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308183775
14	NC_014558	TCT	2	6	838	843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183775
15	NC_014558	AC	3	6	870	875	50 %	0 %	0 %	50 %	308183775
16	NC_014558	GAT	2	6	876	881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183775
17	NC_014558	AGA	2	6	896	901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183775
18	NC_014558	GAA	2	6	1038	1043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183775
19	NC_014558	TTA	2	6	1167	1172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183775
20	NC_014558	TTAT	2	8	1185	1192	25 %	75 %	0 %	0 %	308183775
21	NC_014558	GAT	2	6	1194	1199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183775
22	NC_014558	AGG	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308183775
23	NC_014558	CGT	3	9	1646	1654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183776
24	NC_014558	TAC	2	6	1732	1737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183776
25	NC_014558	TTAG	2	8	1875	1882	25 %	50 %	25 %	0 %	308183776
26	NC_014558	GTC	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183776
27	NC_014558	CGAT	2	8	1947	1954	25 %	25 %	25 %	25 %	308183776
28	NC_014558	TAA	2	6	1961	1966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183776
29	NC_014558	ATC	2	6	2040	2045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183776
30	NC_014558	GATT	2	8	2076	2083	25 %	50 %	25 %	0 %	308183776
31	NC_014558	TAG	2	6	2191	2196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183776
32	NC_014558	T	6	6	2257	2262	0 %	100 %	0 %	0 %	308183776
33	NC_014558	TTG	2	6	2377	2382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183776
34	NC_014558	TTCG	2	8	2455	2462	0 %	50 %	25 %	25 %	308183776
35	NC_014558	ATT	2	6	2782	2787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183777
36	NC_014558	ACA	2	6	2817	2822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183777
37	NC_014558	TGA	2	6	2853	2858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183777
38	NC_014558	ATT	2	6	2908	2913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183777
39	NC_014558	CTG	2	6	3424	3429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183777
40	NC_014558	TTA	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183777
41	NC_014558	CGA	2	6	3502	3507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183777
42	NC_014558	TCA	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183777
43	NC_014558	A	6	6	3585	3590	100 %	0 %	0 %	0 %	308183777
44	NC_014558	A	6	6	3722	3727	100 %	0 %	0 %	0 %	308183778
45	NC_014558	T	6	6	3850	3855	0 %	100 %	0 %	0 %	308183779
46	NC_014558	ATC	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183779
47	NC_014558	TTC	2	6	3877	3882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183779
48	NC_014558	AT	3	6	3883	3888	50 %	50 %	0 %	0 %	308183779
49	NC_014558	CTT	2	6	3957	3962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183779
50	NC_014558	CAG	2	6	3992	3997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183779
51	NC_014558	CAA	2	6	4089	4094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183779
52	NC_014558	TAATT	2	10	4146	4155	40 %	60 %	0 %	0 %	308183779
53	NC_014558	T	7	7	4154	4160	0 %	100 %	0 %	0 %	308183779
54	NC_014558	TAA	2	6	4217	4222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183779
55	NC_014558	TAG	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183779
56	NC_014558	GCCA	2	8	4448	4455	25 %	0 %	25 %	50 %	308183779
57	NC_014558	AAC	2	6	4458	4463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183779
58	NC_014558	ATC	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183779
59	NC_014558	ACA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183779
60	NC_014558	ACTA	2	8	4683	4690	50 %	25 %	0 %	25 %	308183779
61	NC_014558	TTCTT	2	10	4739	4748	0 %	80 %	0 %	20 %	308183779
62	NC_014558	TTG	2	6	4781	4786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183780
63	NC_014558	TG	3	6	4793	4798	0 %	50 %	50 %	0 %	308183780
64	NC_014558	ATA	2	6	4811	4816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183780
65	NC_014558	CAT	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183780
66	NC_014558	CAT	2	6	4948	4953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183780
67	NC_014558	ATT	2	6	4973	4978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183780
68	NC_014558	GTT	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183780
69	NC_014558	A	6	6	5158	5163	100 %	0 %	0 %	0 %	308183780
70	NC_014558	AAAC	2	8	5184	5191	75 %	0 %	0 %	25 %	308183780
71	NC_014558	CAA	2	6	5280	5285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183780
72	NC_014558	GAC	2	6	5303	5308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183780
73	NC_014558	ACC	2	6	5441	5446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308183780
74	NC_014558	AAG	2	6	5468	5473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183780
75	NC_014558	A	6	6	5530	5535	100 %	0 %	0 %	0 %	308183780
76	NC_014558	GCC	2	6	5635	5640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308183781
77	NC_014558	ATG	2	6	5659	5664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183781
78	NC_014558	TAG	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183781
79	NC_014558	TCA	2	6	5680	5685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183781
80	NC_014558	TGC	2	6	5706	5711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183781
81	NC_014558	ATTG	2	8	5736	5743	25 %	50 %	25 %	0 %	308183781
82	NC_014558	CTT	2	6	5805	5810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183781
83	NC_014558	CAT	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183781
84	NC_014558	TGT	2	6	5855	5860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183781
85	NC_014558	ACC	2	6	5944	5949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308183781
86	NC_014558	ACT	2	6	5967	5972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183781
87	NC_014558	T	6	6	6161	6166	0 %	100 %	0 %	0 %	308183781
88	NC_014558	TTTC	2	8	6194	6201	0 %	75 %	0 %	25 %	308183781
89	NC_014558	CAT	2	6	6254	6259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183781
90	NC_014558	GC	4	8	6268	6275	0 %	0 %	50 %	50 %	308183781
91	NC_014558	GCT	2	6	6287	6292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183781
92	NC_014558	GTC	2	6	6324	6329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183781
93	NC_014558	ATCTT	2	10	6478	6487	20 %	60 %	0 %	20 %	308183781
94	NC_014558	TTC	2	6	6504	6509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183781
95	NC_014558	CAA	2	6	6726	6731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183781
96	NC_014558	T	7	7	6732	6738	0 %	100 %	0 %	0 %	308183781
97	NC_014558	TAACTT	2	12	6779	6790	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	308183781
98	NC_014558	TATC	2	8	7284	7291	25 %	50 %	0 %	25 %	308183782
99	NC_014558	ATT	2	6	7362	7367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183782
100	NC_014558	AAGCA	2	10	7372	7381	60 %	0 %	20 %	20 %	308183782
101	NC_014558	ATC	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183782
102	NC_014558	AAG	2	6	7418	7423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183782
103	NC_014558	CT	3	6	7509	7514	0 %	50 %	0 %	50 %	308183782
104	NC_014558	TAA	2	6	7516	7521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183782
105	NC_014558	GT	3	6	7534	7539	0 %	50 %	50 %	0 %	308183782
106	NC_014558	ACA	2	6	7545	7550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183782
107	NC_014558	CTC	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308183782
108	NC_014558	GTG	2	6	7602	7607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183782
109	NC_014558	GAC	2	6	7668	7673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183782
110	NC_014558	ATAA	2	8	7865	7872	75 %	25 %	0 %	0 %	308183782
111	NC_014558	TTC	2	6	7947	7952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183782
112	NC_014558	TGA	2	6	7957	7962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183782
113	NC_014558	T	6	6	8177	8182	0 %	100 %	0 %	0 %	308183782
114	NC_014558	TTA	2	6	8583	8588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183783
115	NC_014558	TAT	2	6	8607	8612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183783
116	NC_014558	CTG	2	6	8619	8624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183783
117	NC_014558	CAA	2	6	8646	8651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183783
118	NC_014558	TAC	3	9	8806	8814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183783
119	NC_014558	AAC	2	6	8815	8820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183783
120	NC_014558	CTG	2	6	8829	8834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183783
121	NC_014558	TGC	2	6	8842	8847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183783
122	NC_014558	CTT	2	6	8874	8879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183783
123	NC_014558	GCT	2	6	8882	8887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183783
124	NC_014558	CAA	2	6	8889	8894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183783
125	NC_014558	GAC	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183783
126	NC_014558	CAA	2	6	8921	8926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183783
127	NC_014558	ATC	2	6	8941	8946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183783
128	NC_014558	CTG	2	6	9024	9029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183783
129	NC_014558	CAA	2	6	9073	9078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183783
130	NC_014558	TGC	2	6	9091	9096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183783
131	NC_014558	TGG	2	6	9124	9129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183783
132	NC_014558	CCAA	2	8	9210	9217	50 %	0 %	0 %	50 %	308183783
133	NC_014558	ATG	2	6	10230	10235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183784
134	NC_014558	CTG	2	6	10251	10256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183784
135	NC_014558	A	6	6	10257	10262	100 %	0 %	0 %	0 %	308183784
136	NC_014558	AAT	2	6	10292	10297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183784
137	NC_014558	AATT	2	8	10594	10601	50 %	50 %	0 %	0 %	308183785
138	NC_014558	ATT	2	6	10620	10625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183785
139	NC_014558	TTTG	2	8	10726	10733	0 %	75 %	25 %	0 %	308183785
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141	NC_014558	TGAT	2	8	10884	10891	25 %	50 %	25 %	0 %	308183785
142	NC_014558	CAA	2	6	10910	10915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183785
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149	NC_014558	CTC	2	6	11321	11326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308183785
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261	NC_014558	GCG	2	6	18826	18831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308183790
262	NC_014558	GTA	2	6	19024	19029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183790
263	NC_014558	TGG	2	6	19074	19079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183790
264	NC_014558	GAA	2	6	19152	19157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183790
265	NC_014558	TCA	2	6	19159	19164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183790
266	NC_014558	AAGCA	2	10	19240	19249	60 %	0 %	20 %	20 %	308183790
267	NC_014558	CGC	2	6	19383	19388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308183791
268	NC_014558	GAA	2	6	19438	19443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183791
269	NC_014558	TTG	2	6	19550	19555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183791
270	NC_014558	CTT	2	6	19611	19616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183791
271	NC_014558	TCG	2	6	19646	19651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183791
272	NC_014558	CATC	2	8	19659	19666	25 %	25 %	0 %	50 %	308183791
273	NC_014558	T	6	6	19680	19685	0 %	100 %	0 %	0 %	308183791
274	NC_014558	TGA	2	6	19773	19778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183791
275	NC_014558	A	6	6	19828	19833	100 %	0 %	0 %	0 %	308183791
276	NC_014558	GTA	2	6	19840	19845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183791
277	NC_014558	AAGA	2	8	19858	19865	75 %	0 %	25 %	0 %	308183791
278	NC_014558	CTTT	2	8	19875	19882	0 %	75 %	0 %	25 %	308183791
279	NC_014558	GTT	2	6	19888	19893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183791
280	NC_014558	ATT	2	6	19945	19950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183791
281	NC_014558	CAT	2	6	20038	20043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183791
282	NC_014558	CTG	2	6	20061	20066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183791
283	NC_014558	CTT	2	6	20067	20072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183791
284	NC_014558	AGTCGT	2	12	20339	20350	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	308183792
285	NC_014558	T	6	6	20360	20365	0 %	100 %	0 %	0 %	308183792
286	NC_014558	ATC	2	6	20422	20427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183792
287	NC_014558	AGG	2	6	20516	20521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308183792
288	NC_014558	AAG	2	6	20563	20568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183792
289	NC_014558	TTC	2	6	20646	20651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183792
290	NC_014558	TCAG	2	8	20791	20798	25 %	25 %	25 %	25 %	308183792
291	NC_014558	T	6	6	20811	20816	0 %	100 %	0 %	0 %	308183792
292	NC_014558	CCG	2	6	20908	20913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308183792
293	NC_014558	TTC	2	6	20997	21002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183792
294	NC_014558	TTG	2	6	21003	21008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183792
295	NC_014558	TGT	2	6	21100	21105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183792
296	NC_014558	CCAA	2	8	21164	21171	50 %	0 %	0 %	50 %	308183792
297	NC_014558	GTG	2	6	21178	21183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183792
298	NC_014558	ATC	2	6	21222	21227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183792
299	NC_014558	GTA	2	6	21243	21248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183792
300	NC_014558	AGT	2	6	21251	21256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183792
301	NC_014558	CATG	2	8	21373	21380	25 %	25 %	25 %	25 %	308183793
302	NC_014558	CATT	2	8	21386	21393	25 %	50 %	0 %	25 %	308183793
303	NC_014558	TCT	2	6	21413	21418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183793
304	NC_014558	TAA	2	6	21434	21439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183793
305	NC_014558	TTA	2	6	21512	21517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183793
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326	NC_014558	T	6	6	22710	22715	0 %	100 %	0 %	0 %	308183793
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342	NC_014558	TTA	2	6	23807	23812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183794
343	NC_014558	ACC	2	6	23821	23826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308183794
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357	NC_014558	ACT	2	6	25639	25644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183754
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359	NC_014558	TGG	2	6	25840	25845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183754
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363	NC_014558	CTAG	2	8	26166	26173	25 %	25 %	25 %	25 %	308183754
364	NC_014558	GCG	2	6	26330	26335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308183754
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371	NC_014558	ATCTG	2	10	27127	27136	20 %	40 %	20 %	20 %	308183755
372	NC_014558	TCA	2	6	27138	27143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183755
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376	NC_014558	TAT	2	6	27289	27294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183755
377	NC_014558	AAC	2	6	27339	27344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183755
378	NC_014558	CG	3	6	27367	27372	0 %	0 %	50 %	50 %	308183755
379	NC_014558	AGT	2	6	27461	27466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183755
380	NC_014558	T	6	6	27493	27498	0 %	100 %	0 %	0 %	308183755
381	NC_014558	ATTTG	2	10	27525	27534	20 %	60 %	20 %	0 %	308183755
382	NC_014558	GTT	2	6	27975	27980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183756
383	NC_014558	CTT	2	6	28009	28014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183756
384	NC_014558	TCG	2	6	28117	28122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183756
385	NC_014558	AATTA	2	10	28147	28156	60 %	40 %	0 %	0 %	308183756
386	NC_014558	AATC	2	8	28162	28169	50 %	25 %	0 %	25 %	308183756
387	NC_014558	TGT	2	6	28244	28249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183756
388	NC_014558	GTT	2	6	28349	28354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183756
389	NC_014558	TGA	2	6	28382	28387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183756
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499	NC_014558	GATCA	2	10	33796	33805	40 %	20 %	20 %	20 %	308183759
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